一直以来,感染性疾病就是全球十大死亡原因之一,无论是年初以来肆虐全球的新冠肺炎,还是近期关中地区流行的出血热。病原微生物复杂多变、耐药菌横生等已成为临床迫切需要解决的难题。为此,圣庭医学基于纳米孔测序平台推出TNP-SeqTM(TargetNanoPoreSequencing),旨在为临床提供病原微生物的精准筛查服务。然而,不同临床科室的感染情况千差万别,今天,小编带大家一些来看下感染的重灾区:呼吸科、血液科、ICU等科室的感染情况以及病原菌精准诊断对这些科室感染控制的重要作用。
1
呼吸科
流行病学
每年全世界约有万人死于肺炎等下呼吸道感染。社区感染率18%,院内感染率30%,此外,全球约有10亿人患有慢性呼吸道疾病。
检测痛点
定植菌污染严重:
呼吸道样本取样时易被口腔菌污染,口腔菌的优势生长阻碍了真正病原菌的检测,使精准诊断难以实现。
厌氧菌难以检测:
厌氧菌通常以混合感染形式引起肺脓肿等下呼吸道感染性疾病,但因其离体后暴露于空气中立即死亡,难以用传统培养手段检出。
检测周期长:
呼吸科感染涉及多种病原菌,如细菌、真菌、厌氧菌、结核等胞内菌,一般的病原体培养需3-5天,结核等特殊病原体培养需1个月甚至更长时间,检测周期长且无法一次性覆盖所有常见病原菌。
TNP-seqTM检测优势
方法学:
基于核酸测序的方法,对死菌、活菌、定植菌、感染菌无偏移进行检测,后端依据指南和专家共识进行医学解读,辅助区分定植菌与感染菌。
专利:
实验端采用专利的破壁技术解决胞内菌、真菌检测难题;通过一次检测,实现细菌、真菌、胞内菌、病毒的广谱筛查。
时效快:
基于独特的实时分析技术,边测序边生信分析,稳定维持2天内出具报告。
应用场景
根据呼吸科检测痛点及我们的产品优势,TNP-seqTM的临床应用场景及科研应用场景如下:
临床场景:
科研场景:
ICU呼吸机相关性肺炎病原菌检测方案:同一病人不同病程阶段菌群差异比较;不同疾病表型的病人菌群差异比较;治疗后到再次感染间歇期菌群变化的实时监测。
结核分枝杆菌和非结核分枝杆菌:明确、区分有无结核和非结核、是否合并其他感染。
非典型、无法培养病原菌:肺炎支原体、衣原体、耶氏肺孢子菌、解脲脲原体。
肺部混合感染:细菌+真菌;多种细菌;多种真菌;
真菌性肺炎:如常见曲霉菌、毛霉、根霉。
2
血液科
流行病学
社区感染率14%,院内感染率34%;全球败血症总体死亡率达24%;ICU患者发生血流感染后死亡率更是高达80%。
检测痛点
时间就是生命
败血症爆发后6小时有效治疗时间,期间生存率以7.6%/h逐渐降低,最终低至14.5%,因此,第一时间明确感染病原菌,给予合理的药物干扰至关重要。
灵敏度就是生命:
血液样本由于其高宿主低微生物载量的特点,使病原菌检测更为困难,传统血培养阳性率仅为30%;因难以明确病原菌导致46%的不合理经验性治疗,直接导致高达24%的死亡率。
TNP-seqTM检测优势
高灵敏:
采用靶向高通量测序的方法,在实验端去除人源宿主,进一步放大微生物信号后,实行靶向测序,双管齐下,保证检测无漏网之鱼。
时效快:
基于独特的实时分析技术,边测序边生信分析,稳定维持2天内出具报告,紧急情况下当天报告。
应用场景
根据血液科检测痛点及我们的产品优势,TNP-seqTM的临床应用场景及科研应用场景如下:
临床场景:
科研场景:
肛周拭子早期筛查方案:肠道定植菌与血流感染发生的相关性,相关性最强的肠道标本及肠道菌群随感染发生发展的变化。
口腔拭子早期筛查方案:口腔溃疡的在血液科移植术后的普遍性;呼吸道定植菌与血流感染发生的相关性。
特殊人群筛查方案:如CAR-T治疗后患者的真菌早期筛查方案,此类患者移植前肠道灭菌和皮肤灭菌,为典型的真菌易感患者,且;临床抗真菌预防存在漏洞。
3
ICU
流行病学
院内感染率35%,60岁以上患者院内感染率高达59%,感染部位复杂,以下呼吸道为主,其次为泌尿道、胃肠道,且加大几率发展为全身多部位感染。
检测痛点
病原体种类复杂:
由于ICU感染部位多,经常存在各种病原体感染甚至混合感染,及一些罕见病原菌感染,成为精准诊断和治疗的难题。
病情危重:
ICU患者存在诸多感染高危因素,随时都有生命危险,病原菌检测时间越长,精准药物治疗延迟越长,死亡率越高。
TNP-seqTM检测优势
广覆盖:
对样本中的病原微生物一网打尽,检测数据库包含细菌种、真菌种、病毒种、支原体、衣原体等非典型病原体种,快速明确ICU患者感染情况。
时效快:
基于独特的实时分析技术,边测序边生信分析,稳定维持2天内出具报告,紧急情况下当天报告。
应用场景
根据ICU检测痛点及我们的产品优势,TNP-seqTM的临床应用场景及科研应用场景如下:
临床场景:
科研场景:
针对特定疾病类型疾病的病原菌感染监测,—以呼吸机相关肺炎为例,探究某类临床/科学问题。
广泛的病原菌筛查,疑难病原菌、罕见病原菌感染,反复感染培养阴性的病例,可发表casereport类型的paper。
TNP-seqTM介绍
浙江圣庭医学检验有限公司由国内医药上市公司天宇股份(702)和美国资深基因科学家联合创办,公司采用最新的第三代纳米孔测序技术,推出TNP-SeqTM(TargetNanoPoresequencing),检测原理:当病原微生物的单链核酸分子通过测序仪纳米孔时,捕捉碱基电流信号,超长读长测序,精准识别核酸序列,并实时分析,实现病原微生物的快速,准确的鉴定,圣庭医学推出的TNP-SeqTM病原微生物快速检测方案与全国多家医疗单位、科研院所等机构展开了密切的合作,立志打造基因检测和精准定制化解决方案。
产品优势
快:基于独特的实时分析技术,边测序边生信分析,稳定维持2天内出具报告;
准:超长读长,提高物种分辨率,保证鉴定结果的准确性;
敏:去除人源核酸干扰,放大微生物信号,在低丰度病原微生物检测上具有独特的优势;
广:无需提前预判病原体,细菌、真菌、病毒、特殊病原体海量筛查;
控:严格的实验室内参和医学解读质控保驾护航,实现每例样本快速、准确的检测。
圣庭医学的愿景:“急你所疾,精准洞见”,用优良的准确率、价格和时间,为临床提供更触手可及的临床感染诊断解决方案,助力临床病原微生物精准检测。
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